Az Aprilia versenyzője, Marco Bezzecchi kaotikus körülmények között szerezte meg a vezető helyet a Japán Nagydíj pénteki edzésén 1:43.193-as idővel, pedig az FP1-ben kétszer is bukott. A drámai időmérős szekció végén sikerült maga mögé utasítania a KTM-es Pedro Acostát, aki a gyakorlás utolsó perceiben az első kanyarban bukott az RC16-osával.
A bajnoki éllovas Marc Marquez a harmadik helyen végzett egy nehéz pénteki napon a gyári Ducatival, miközben továbbra is az első lehetőségét keresi a 2025-ös MotoGP világbajnoki cím megszerzésére ezen a hétvégén.
A spanyol versenyzőnek csak három ponttal kell többet szereznie öccsénél, Alex Marqueznél a vasárnapi verseny végéig, hogy bebiztosítsa a címet.
Ez a feladat egy kicsit könnyebbé vált, miután a Gresini-pilóta gyenge teljesítményt nyújtott GP24-esével az edzésen. Alex Marquez a végső időmérős részben a mezőny hátuljában tartózkodott, majd utolsó körében döntő hibát követett el, így 15. helyen végzett és nem jutott be a Q2-be. Ez az idei első Q1-es szereplése, így Marc Marquez maradt az egyetlen versenyző a 2025-ös mezőnyben, aki minden helyszínen közvetlenül a Q2-be jutott.
Az edzés első tíz perce után Alex Marquez gresinis csapattársa, Fermin Aldeguer állt az élen egy 1:44.423-as körrel. Már húsz perc elteltével több pilóta is friss lágy gumikon próbálkozott gyors körökkel.
A VR46 Ducatis Fabio Di Giannantonio 35 perccel a vége előtt vette át a vezetést 1:44.294-gyel, majd a Yamahás Fabio Quartararo előzte meg 1:44.044-es idővel. Ugyanekkor mindkét gyári Ducati-pilóta - Pecco Bagnaia és Marc Marquez is - problémákkal küszködött, amire a többszöri ideges garázsba vonulás utalt.
Quartararo ideje egészen a záró 15 percig volt érvényben, amikor Pedro Acosta váltotta őt az élen, majd gyorsan Luca Marini vette át a vezetést 1:43.884-gyel. Bezzecchi azután állt először az élre 1:43.623-mal, mielőtt Acosta újra visszavette volna a vezetést 1:43.557-tel.
Az utolsó öt percben az FP1 legjobbja, Bagnaia villámgyorsan az élre ugrott 1:43.539-gyel, majd Joan Mir és ismét Acosta váltották egymást az élen. Acosta az első kanyarban esett el, amikor áthaladt a célvonalon 1:43.329-es idejével. Ez azonban nem volt elég az első helyhez, mert Bezzecchi az utolsó körében 1:43.193-ra javított.
A végeredményben Mir a negyedik helyet szerezte meg Di Giannantonio és Marini előtt, míg Bagnaia hetedikként zárt Quartararo, a Trackhouse-os Raul Fernandez és az LCR Honda versenyzője, Johann Zarco előtt. Zarco késői 1:43.734-es ideje mindössze 0,008 másodperccel szorította ki Aldeguert a Q2-ből.
A címvédő Jorge Martin kétszer is elesett Apriliájával az edzésen, így 13. lett, míg Franco Morbidelli, Jack Miller és Somkiat Chantra késői bukásai akadályozták meg őket abban, hogy a legjobb tízbe kerüljenek.

