Ahogy az várható volt, eső érkezett Szászországba. Több mint 12 hónap után először esős körülmények között dőlt el a MotoGP rajtelsőség a csúszós aszfalton. Mivel a versenyzők már az FP2-n is vizes gumikon teljesítettek köröket, a királykategória legjobb 12 pilótájának már volt elképzelése saját határairól.
Johann Zarco (Honda) és Maverick Vinales (KTM) előnyre számíthatott, hiszen a két veterán versenyző lenyűgöző teljesítménnyel jutott tovább a Q1-ből a döntő szakaszba.
Maverick Vinales számára azonban azonnal minden félresikerült. A spanyol a negyedik kanyarban bukott, majd orvosi vizsgálatra szorult. A vizes aszfalton uralkodó nehéz körülmények egy perccel később újra megmutatkoztak, amikor az esős körülmények specialistája, Jack Miller ugyanott csúszott ki.
Amikor az első versenyzők mért körrel haladtak át a célvonalon, az óra 1:31 perces időket mutatott, ami jelentősen lassabb volt a Q1-hez képest. Franco Morbidelli, Brad Binder és Marc Marquez azonban hamarosan nagyobb magabiztosságra tett szert, és átvették a vezetést a 15 perces szakaszban.
A világbajnoki címvédő Marquez sem tétlenkedett, előbb 1:28.730-as, majd 1:28.294-es időt futott az esőben. A 93-as rajtszámú versenyző lenyűgöző visszatérést produkált a leggyorsabb idővel a borzalmas körülmények között, több mint 1,3 másodperccel előzve meg a második helyre felzárkózó Zarcót.
Mögöttük Morbidelli, Binder és az időmérőn korábban dominált Fabio Di Giannantonio helyezkedett el. Négy perccel a vége előtt az Aprilia versenyzője, Marco Bezzecchi is kiváló kört teljesített, amivel a második helyet szerezte meg „Bezz" számára.
A Le Mans-i győztes Johann Zarco azonban nem adta fel a küzdelmet. A Honda éllovasa az utolsó előtti körön 0,065 másodpercre közelítette meg Marc Marquezt. Míg Acosta az ötödik helyre jött fel Morbidelli mögött, Marc Marquez tovább fokozta a tempót. A rajtelsőség végül a cerverai Ducati gyári versenyző kezébe került 1:27.811-es körével, Zarco és Bezzecchi pedig kiegészítették az első sort. Morbidelli az utolsó körén kicsúszott, de így is megtartotta a negyedik helyet.
A GP nagyágyúi közül Pecco Bagnaia nem volt magabiztos. A kétszeres világbajnok csak a tizenegyedik időt érte el, így a rajtrács negyedik sorából indulhat. A legjobb Yamaha versenyzőként Fabio Quartararo a hetedik helyen végzett. A világbajnoki második helyezett Alex Marquez jó rajtpozíciót szerzett a szászországi két futamra, a hatodik helyen zárva az időmérőt.